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在人工智能快速发展的今天,大语言模型(LLM)在医疗领域的应用一直备受关注。近日,来自哈佛大学、乔治亚大学等多家顶尖研究机构的研究团队联合发布了一项重磅成果:基于Llama2架构专门针对放射科领域优化的大语言模型Radiology-Llama2。该模型在放射科报告理解和生成方面展现出卓越性能,在多个评估指标上显著超越包括GPT-4在内的主流大语言模型。
随着ChatGPT等大语言模型的兴起,AI在医疗领域的应用备受瞩目。然而,通用大语言模型在特定专业领域仍面临诸多挑战:
数据隐私问题:医院由于隐私法规限制,无法直接使用商业模型如ChatGPT或GPT-4处理患者数据。
专业知识欠缺:通用模型缺乏深度的医学专业知识,特别是在放射科等高度专业化的领域。
表达方式不符合临床习惯:通用模型往往生成类似维基百科式的冗长回答,而非放射科医生习惯的简洁专业表述。
基于此,研究团队开发了Radiology-Llama2,旨在打造一个真正适合临床实践的专业放射科辅助工具。
论文图1展示了Radiology-Llama2的整体框架图,显示了模型的训练流程:从MIMIC数据库获取放射科报告数据,通过指令微调来优化Llama2模型,最终生成高质量的放射科诊断意见。
Radiology-Llama2的核心技术创新包括:
研究团队选择了Llama2-7b-chat作为基础模型,采用低秩适应(LoRA)技术进行优化。LoRA的主要优势在于:
模型采用了精心设计的指令微调策略:
模型训练的具体参数配置:
LoRA参数设置:
训练硬件环境:4台NVIDIA A100 80GB GPU
论文表2展示了在MIMIC-CXR和OpenI数据集上的评估结果,Radiology-Llama2在所有评估指标上都显著优于其他模型:
在MIMIC-CXR数据集上:
在OpenI数据集上:
这些成绩显著超越了包括ChatGPT、GPT-4、Claude2等主流模型。
论文图4展示了放射科专家对不同模型输出的评估结果,从五个维度进行评价:
论文图2和图3展示了具体的案例比较,清晰展示了Radiology-Llama2相比其他模型的优势:
Radiology-Llama2在实际临床环境中具有广泛应用潜力:
研究团队提出了几个重要的发展方向:
目前该研究已在arXiv上公开发表,论文编号为arXiv:2309.06419。感兴趣的读者可以通过以下链接了解更多信息:
https://github.com/WangRongsheng/XrayGLM
Radiology-Llama2的成功开发标志着专业领域大语言模型的重要突破。它不仅展示了在特定领域超越通用模型的可能性,也为其他医疗专科AI助手的开发提供了宝贵经验。随着技术的不断完善和临床实践的深入,我们有理由相信,这类专业化的医疗AI助手将在提升医疗质量、优化医疗资源分配方面发挥越来越重要的作用。
Q1: Radiology-Llama2使用的LoRA技术具体是如何工作的?为什么选择在query和value矩阵上进行优化?
LoRA (Low-Rank Adaptation) 是一种参数高效的模型微调技术,其核心思想是通过低秩分解来表示权重更新。在Radiology-Llama2中,研究团队特别选择了对注意力机制中的query和value矩阵进行优化,这一选择具有深刻的技术考虑。
具体来说,对于原始的权重矩阵 ,LoRA不直接更新W,而是学习一个低秩更新:,其中 ,,r是一个很小的秩(在本研究中r=8)。最终的权重更新表示为:
其中α是缩放因子(本研究中α=16)。这种方法可以将需要优化的参数量从 减少到 。
选择优化query和value矩阵的原因是:这两个矩阵在注意力机制中分别负责查询信息和存储值信息,对生成高质量的医疗文本起着关键作用。Query矩阵决定了模型如何寻找相关信息,而value矩阵决定了如何表达这些信息。在医疗领域,准确的信息检索和表达尤其重要。
Q2: Radiology-Llama2的指令微调(Instruction Tuning)过程是如何设计的?为什么这种设计能够提升模型性能?
Radiology-Llama2的指令微调采用了精心设计的策略,主要包含三个关键环节:指令设计、数据配对和训练目标设定。
首先,指令设计采用了"Derive the impression from findings in the radiology report"这样简洁明确的指令模板。这种设计的优势在于:
在训练过程中,损失函数设计如下:
其中:
这个损失函数通过最大化条件概率来优化模型,使其能够根据发现文本和指令生成准确的印象内容。
Q3: Radiology-Llama2是如何处理医学术语和专业表达的?模型的词汇表和分词策略有什么特别之处?
Radiology-Llama2在处理医学术语方面采用了多层次的策略。首先,在词汇表层面,模型继承了Llama2的分词器,但通过在医学领域的微调过程中学习到了专业术语的上下文表示。
对于专业术语的处理,模型使用了上下文敏感的表示方法。假设一个医学术语 在上下文 中出现,其表示可以表达为:
其中:
这种表示方法使得模型能够:
Q4: ROUGE评估指标在放射科报告评估中的适用性如何?模型是否考虑了其他更专业的评估指标?
ROUGE评估指标虽然在文本生成领域被广泛使用,但在放射科报告这样的专业领域,它的应用需要特别考虑。在Radiology-Llama2中,研究团队使用了多个ROUGE变体进行评估:
ROUGE-N的计算公式为:
ROUGE-L使用最长公共子序列(LCS)计算:
其中:
除了ROUGE指标,研究团队还设计了专门的专家评估体系,包括:
Q5: Radiology-Llama2在处理罕见病例或非典型表现时的策略是什么?模型如何避免过度泛化?
在处理罕见病例和非典型表现时,Radiology-Llama2采用了一套复杂的策略来平衡准确性和谨慎性。这个策略主要体现在模型的注意力机制和决策过程中。
首先,模型使用了一个基于不确定性的注意力计算方法:
其中M是一个不确定性掩码矩阵:
这使得模型在遇到不确定情况时会:
同时,模型还实现了一个基于置信度的输出控制机制:
其中confidence(x)是模型对当前输入的置信度评估,这帮助模型在生成报告时能够适当地表达不确定性,特别是在面对罕见或非典型案例时。
这些技术细节的结合使得Radiology-Llama2能够在保持高准确率的同时,对罕见和非典型案例保持恰当的谨慎态度,这对于医疗AI系统来说是极其重要的特性。
Q6: Radiology-Llama2的训练过程中如何处理数据不平衡问题?特别是对于罕见病例的处理策略是什么?
在医疗数据中,不同类型病例的分布往往是不平衡的。Radiology-Llama2采用了多层次的策略来解决这个问题。首先,在数据采样层面,模型使用了一个动态加权的采样策略:
其中:
这个采样策略确保了罕见病例能够得到足够的训练机会,同时又不会过度影响常见病例的训练效果。
在损失函数层面,模型引入了基于类别频率的加权交叉熵损失:
其中权重 的计算考虑了类别频率和临床重要性:
这里:
Q7: Radiology-Llama2在处理多模态信息时的具体实现方式是什么?如何整合不同类型的医疗数据?
虽然当前版本的Radiology-Llama2主要处理文本数据,但模型架构设计时就考虑了多模态扩展的可能性。在处理多模态信息时,模型采用了一个层次化的编码结构:
对于文本信息,使用标准的transformer编码:
对于图像信息(预留架构):
然后通过跨模态注意力机制进行信息融合:
其中融合后的表示计算为:
这种设计允许模型:
Q8: Radiology-Llama2如何确保生成内容的一致性和连贯性?在长文本生成中是否有特殊的控制机制?
在医疗报告生成中,保持内容的一致性和连贯性至关重要。Radiology-Llama2通过几个关键机制来实现这一目标:
首先,在生成过程中使用了一个基于图结构的一致性检查机制:
其中:
对于每个生成步骤,模型计算一个一致性得分:
其中Compatibility函数评估两个发现之间的逻辑兼容性。
在生成过程中,模型使用滑动窗口注意力机制来维持长程依赖:
这里:
Q9: 模型在医学知识整合方面采用了什么创新方法?如何保证专业知识的准确性?
Radiology-Llama2在医学知识整合方面采用了一个多层次的知识表示系统。首先,构建了一个医学知识图谱:
其中:
模型使用知识感知的注意力机制:
其中 是基于知识图谱的注意力偏置矩阵:
这使得模型能够:
Q10: Radiology-Llama2如何处理时序信息,特别是在需要比较历史检查结果时?
在处理需要时序比较的病例时,Radiology-Llama2实现了一个特殊的时序注意力机制。首先,定义时序特征表示:
其中:
然后使用时序感知的自注意力机制:
其中是时间位置编码:
最终的时序表示通过加权组合得到:
这种设计使模型能够:
在具体实现中,模型还加入了一个时序一致性损失项:
$L_{temporal} = \sum_{i<j} \text{consistency}(h_i,="" h_j,="" t_i="" -="" t_j)$<="" p="">
这确保了模型在处理时序信息时能够保持逻辑一致性,特别是在描述病情进展和变化时。这对于放射科报告的准确性和临床价值都是至关重要的。
硬件要求:
方法一:完整安装(包含训练所需的deepspeed)
# 国内用户推荐使用阿里源安装
pip install -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/ -r requirements.txt
方法二:仅推理安装(适合Windows用户)
# 绕过deepspeed安装
pip install -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/ -r requirements_wo_ds.txt
# 单独安装SAT库
pip install -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/ --no-deps "SwissArmyTransformer>=0.3.6"
目前提供两个版本的模型权重:
下载后将权重文件放置在checkpoints
目录下。
基础使用命令:
python cli_demo.py --from_pretrained checkpoints/checkpoints-XrayGLM-3000 --prompt_zh '详细描述这张胸部X光片的诊断结果'
重要参数说明:
--from_pretrained
: 模型权重路径--prompt_zh
: 中文提示语cli_demo.py
文件启动Web服务:
python web_demo.py --from_pretrained checkpoints/checkpoints-XrayGLM-3000
访问http://127.0.0.1:7860
即可使用Web界面。
data/Xray
目录下。export CUDA_VISIBLE_DEVICES=0,1,2,3
bash finetune_XrayGLM.sh
OpenI-zh数据集:
如果您是Google Colab Pro会员,可以直接使用Colab运行XrayGLM:Colab链接
# 加载图片
image_path = './data/Xray/861_1.png'
# 示例对话
questions = [
"这是一张什么图?",
"请描述这张胸部X光片的诊断结果",
"是否存在肺气肿?",
"平时饮食该注意什么?"
]
@misc{wang2023XrayGLM,
title={XrayGLM: The first Chinese Medical Multimodal Model that Chest Radiographs Summarization},
author={Rongsheng Wang, Yaofei Duan, Junrong Li, Patrick Pang and Tao Tan},
year={2023},
publisher = {GitHub},
journal = {GitHub repository},
howpublished = {\url{https://github.com/WangRongsheng/XrayGLM}},
}
本项目采用CC BY-NC-SA许可证。
通过以上详细指南,您应该能够顺利地使用XrayGLM项目进行研究和开发工作。如有任何问题,欢迎通过GitHub Issues进行反馈。
Liu Z, Li Y, Shu P, et al. Radiology-llama2: Best-in-class large language model for radiology[J]. arXiv preprint arXiv:2309.06419, 2023.
———— end ————
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